起，南京应天八县所有举子秀才童生监生，含外地士子，编入锦衣卫宣传司，配合锦衣卫将南京疫情和中枢决策传达到每村每户，保障情报讯传通畅。逃役者，除学籍，废三代科举。造谣传谣者，立斩不赦。”
“遵上谕，即刻起，孝陵大营含孝陵卫设为特级疫区，施行特级管理办法。南京城及上元江宁二县设为重级疫区，施行重级管理办法。应天府其余六县及警备区运河两岸归入疫区，施行疫区管理办法。镇江、扬州、常州、宁国、太平、凤阳六府非运河区为一级警备区，施行一级警备管理办法。淮安、通州、庐州、寿州、徽州、苏州、松江、扬州八府非运河区为二级警备区，施行二级警备办法。具体办法散朝后会立即发放诸县令知府。”
“遵上谕，向天下医者发勤王令。邀全国医者来南京共度时艰，各地官府应予以协助。令太医院组织太医南下。现已飞鸽传书北京内阁，调配粮食物资援助南京，各地有艾草，苦蒿等物产者，须组织增援。”
“陛下谕南直隶诸官员百姓将士：此疫为太祖对子孙的考验，此疫是炎黄儿女对命运的抗争，此为护国保民之国战，朕为天下统帅，不离疫区，不弃一民。”