有了充足的士兵来源后，这些枢密大臣在安排京城卫所时，就更加游刃有余了。
尤其是负责卫所改制的袁可立，最想清理积弊建立一番功业，向一众枢密大臣道：
“亲军三十六卫，自有陛下安排。”
“五城兵马司下属的十五卫，就按之前商定的办法，每卫分配四五百顷土地，编成135名世官和500世袭军士的简编卫。”
“五军都督府八卫，让他们自己想办法。反正五军都督府在京城周边，有不少草场能屯垦。”
“六个匠卫有装备部和工部安排，天津六卫按地方卫所改。”
“最后剩下的，就是十二个陵卫和大宁五卫。”
“这十二个陵卫，陛下有什么指示？”
最后这句话，是向御马监掌印李凤翔说的。
十二陵卫虽然不属于亲军卫，但是如何安排，显然需要请示皇帝。
李凤翔没有直接回答，询问袁可立道：
“诸位都是如何打算的？”
“要如何安排天寿山十二陵卫？”
袁可立没有回答，而是看向朱燮元。
这位长城督师、经常回京管事的枢密大臣道：
“陵卫编制不小，但是缺额甚多。”
“嘉靖年间，便有‘护陵八卫之军，数不满万’之说。”
“嘉靖二十九年草原部族南侵，抵达陵区的东山口，陵卫之众无一执梃之人以御之。朝廷只能从京营调拨三大支人马防守红门、东西山口，因为调度失当，陵区康陵园、工部厂等处均遭到抢掠。”
“事后，朝廷从八个陵卫抽调人员编为两营，其中永安营4000人，巩华营3000人。”
“后来又升格为昌平镇，专管入卫边兵，防守皇陵，天寿山守备成为昌平总兵下属。”
这是陵区的大体管理，实际还要更复杂。
那就是因为还有一部分陵军没有编入营兵，这些人“买闲挂名，平日不习金鼓”的现象比较普遍，根本无法承担守卫皇陵的重任。
天启元年的时候，蓟辽总督文球等人对未编入营兵的陵军实行“更番”法，将他们“与昌平营军更番上山，一年一换”。
这和当今皇帝推行的“以卫所为兵源，以营兵为战力”、“一半负责当地守卫和屯垦、一半轮番赴京赴边”，已经比较相似。
惟一的区别，就是卫所管理仍是旧制。不像当今皇帝，直接把地分给将士做世业田。
所以陵卫的逃亡比较严重，世官数量比较多，军户数量则只有三成
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