和后来的东罗马，政治水平也都有了很大提升，对地方的控制力度远强于古典时代。对缓过劲的双方来说，亚美尼亚很快变得不再必要，最终在四世纪被瓜分。西侧成为罗马行省，东侧成为波斯总督区。
阿拉伯人崛起之后，取代波斯，继续控制亚美尼亚，直到阿拔斯王朝也衰落分裂，东罗马多次出兵高加索，削弱阿拉伯人对当地的统治，亚美尼亚地区也再次出现了一些独立的诸侯国。但这些势力，依然越来越难以让皇帝放心。
巴西尔二世的时候，亚美尼亚人介入罗马内战，还勾结格鲁吉亚人一起叛乱，引起了强烈的不满。巴西尔率领军队攻入亚美尼亚，大败联军，把所有俘虏的眼睛全部刺瞎，作为报复。亚美尼亚人大为惊恐，各小国纷纷投降，请求内附。大部分独立诸侯，都被东罗马吞并。
此时，亚美尼亚地区，只剩下巴格拉图尼王国，在之后几十年的时间里尚且独立。东罗马进攻未果，就诱骗国王前往君士坦丁堡谈判。国王信以为真，率领使团前去，结果遭到扣押，被迫同意放弃领土。随后，就遭到流放，并在途中被几个希腊人刺杀。最后的亚美尼亚王国也就此灭亡。
不过使团里，一个王室成员逃了出来，来到了奇里乞亚，收拢当地的亚美尼亚难民，希望继续抵抗罗马。这个时候，突厥人正在西进，并且在曼奇科特打败罗马人。小亚地区一片大乱，这个小王国也得以幸存下来。
此后，借助十字军的帮助，王国得以和其他势力周旋。蒙古人到来之后，亚美尼亚人又立刻和蒙古人结盟，成为后者在当地最重要的支持者之一。伊儿汗国改宗之后，也没有改变各方关系，蒙古——亚美尼亚——法兰克联盟，依然在努力对抗强盛的马穆鲁克北上。
伊儿汗国瓦解之后，联盟失去了主心骨，终于无力抵抗，奇里乞亚也在1375年被马穆鲁克占领，末代国王逃亡西欧，最终客死巴黎。
不过，马穆鲁克的治理能力比较低下，难以有效管理这片复杂遥远的土地，这片失去管控的地带，很快成了土库曼人的乐园。周围山上的部落，纷纷迁徙到奇里乞亚平原上。塞浦路斯岛上的法兰克人，也趁乱来分一杯羹。而迁徙的土库曼人，又引来了帖木儿皇叔前来圣战……
一番混战之后，这地方算是彻底给打散了。亚美尼亚人跑得到处都是，一直到这会儿，还是
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